防渗膜的铺设是灌区防渗效果的关键之所在，因此要严格控制其在施工过程中的质量。主要包括原材料的采购、材料进场后的质量控制、施工的操作过程和铺设完毕后的质量检测。
(1)、原材料采购阶段的质量控制
(2)、材料进场后的质量控制
进场的防渗膜必须要有相对应的厂家提供的质量合格证书、性能及特性指标和说明书。同时，施工单位要会同现场监理随机抽取试样送相关部门进行质量复测。合格后方能使用。
(3)、施工操作过程控制
合理计划铺设程序，确定铺设过程中的质量控制措施和进度计划。铺设前检查现场有无尖硬物，以免对防渗膜的刺坏和破损。现场的施工人员应穿软底或平底鞋，防渗膜铺设的进度要和保护层的施工进度相协调，不应过快，足保护层的浇筑或填筑即可，避免其在阳光下暴晒而造成防渗膜的风化和老化。
(4)、质量检测
在防渗膜铺设完毕后，要对其铺设质量进行检测，通常使用的方法有目测法和现场检测法。观察其有无漏缝、漏焊的地方，接缝是否有烫损，铺设平面有无褶皱；现场检测可用充气或充水法进行，看其有无漏气或漏水现象发生。